Validation du kit Nextera DNA Sample Library Preparation

Groupement Hospitalier de la Pitié Salpêtrière
15 octobre 2015

Depuis sa sortie en août 2014, L’ACSIA NGS Edition n’a cessé d’évoluer et d’étoffer son catalogue de kits automatisables (NEB Next Ultra, KAPA Library Preparation, Agilent Sureselect , NimbleGen SeqCap EZ library…).

Loin de s’en satisfaire et voulant vous fournir une solution toujours plus complète, notre équipe continue le développement de notre plateforme et vient de valider sur cette dernière le Nextera DNA  Sample Library Preparation Kit d’Illumina.

Avec l’aide du Centre de Génétique Moléculaire et Chromosomique du groupement Hospitalier Pitié Salpêtrière, nous avons cherché à optimiser les paramètres critiques rentrant dans l’étape de la tagmentation (Principe de base du protocole Nextera DNA Sample Library Preparation Kit).

Notre équipe a ensuite utilisé ces paramètres lors de la validation du kit et a obtenu  des résultats plutôt probants  comme  en atteste  la concentration Pre-PCR en fin de process qui est 2 fois supérieur avec l’ACSIA que manuellement.

Manuel : 

Traitement ACSIA NGS Edition

  • Pic majoritaire à 334 pb
  • Concentration  de Pre-PCR  estimée par CLARIOstar  → 384 pg/µL

ACSIA NGS Edition :

Traitement manuel

  • Pic majoritaire à 297 pb
  • Concentration  de Pre-PCR  estimée par CLARIOstar  → 852 pg/µL

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